Arabinosa adalah gula lima karbon yang ditemukan secara luas di alam dan dapat berfungsi sebagai satu-satunya sumber karbon pada banyak bakteri. Produk protein dari tiga gen (araB, araA, dan araD) diperlukan untuk degradasi arabinosa pada anggota famili Enterobacteriaceae, seperti E. coli dan S.
Apa pengaruh arabinosa terhadap bakteri?
Jadi ketika arabinosa hadir untuk mengaktifkan operon arabinosa, GFP diproduksi dan bakteri dapat berfluoresensi. Tanpa arabinosa, gen GFP tidak diekspresikan dan tidak ada fluoresensi. Jadi dengan memvariasikan komposisi nutrisi, peneliti dapat mengontrol kapan (dan jika) pembungaan terjadi pada bakteri yang diubah.
Apa peran arabinosa dalam transformasi bakteri?
Arabinosa bertindak sebagai pengatur alosterik AraC, mengubah situs DNA mana yang diikatnya dan bagaimana ia membentuk dimer. Ingatlah bahwa arabinosa adalah gula yang dikatabolisme oleh protein operon AraBAD. Ketika arabinosa ditambahkan ke lingkungan di mana E. coli hidup, ia mengikat kuat AraC.
Mengapa arabinosa digunakan?
Penggunaan dalam biologi
Dalam biologi sintetik, arabinosa sering digunakan sebagai saklar satu arah atau reversibel untuk ekspresi protein di bawah Pburukpromotor di E. coli. On-switch ini dapat dinegasikan dengan adanya glukosa atau dibalikkan dengan penambahan glukosa dalam media kultur yang merupakan bentuk represi katabolit.
Bagaimanaapakah arabinosa mempengaruhi regulasi dan ekspresi gen pada bakteri?
Ketika arabinosa hadir, araC merelaksasi konfigurasi DNA sehingga transkripsi dapat terjadi, tetapi ketika karbohidrat ini tidak ada, protein yang sama membatasi DNA untuk mengurangi kemampuannya untuk mengikat dengan RNA polimerase.
