Karena DdNTP memiliki molekul hidrogen (-H) dan bukan gugus hidroksil (-OH) yang terikat pada 3'-C deoksiribosanya, ia tidak dapat mengikat nukleotida yang masuk. Oleh karena itu, penambahan DdNTP selama replikasi DNA dapat digunakan untuk menghentikan reaksi sintesis.
Mengapa sintesis DNA berhenti ketika ddNTP dimasukkan ke dalam untai DNA yang sedang tumbuh?
Jika nukleotida yang ditambahkan adalah "dideoksinukleotida" (Gambar 6.29), ujung 3' dari untai yang tumbuh sekarang akan memiliki H, bukan OH. Ini akan mencegah penambahan nukleotida tambahan; yaitu, sintesis DNA in vitro akan berhenti pada titik ini.
Bagaimana ddNTP menghentikan sintesis DNA?
Ketika ddNTP dimasukkan ke dalam rantai nukleotida, sintesis berakhir. Ini karena molekul ddNTP tidak memiliki gugus hidroksil 3', yang diperlukan untuk membentuk ikatan dengan nukleotida berikutnya dalam rantai.
Mengapa DdNTP menghentikan proses replikasi?
Metode Laboratorium dalam Enzimologi: DNA
Dideoxynucleotide triphosphates mudah dimasukkan ke dalam rantai DNA yang sedang tumbuh, tetapi tidak memiliki 3′ gugus hidroksil yang diperlukan untuk memungkinkan rantai tersebut berlanjut, dan secara efektif menghentikan polimerisasi.
Mengapa Dideoksinukleotida menyebabkan replikasi DNA berhenti?
DDNTP ini tidak memiliki gugus 3′-OH yang diperlukan untuk pembentukan ikatan fosfodiester antara duanukleotida, menyebabkan perpanjangan untai DNA berhenti ketika ddNTP ditambahkan.