Prolin sering ditemukan di ujung heliks atau pada putaran atau loop. Tidak seperti asam amino lain yang ada hampir secara eksklusif dalam transformasi polipeptida, prolin dapat eksis dalam konfigurasi cis dalam peptida.
Apakah alfa heliks mengandung residu prolin?
Sekarang ada lebih dari 30.000 struktur protein di Protein Data Bank, jelas bahwa residu prolin ada di -heliks, di mana mereka sering memainkan peran penting dalam struktur dan fungsi protein.
Asam amino apa yang ada dalam heliks alfa?
Salah satu dari 20 asam amino dapat berpartisipasi dalam -helix tetapi beberapa lebih disukai daripada yang lain. Ala, Glu, Leu, dan Met paling sering ditemukan di heliks sedangkan, Gly, Tyr, Ser, dan Pro lebih jarang terlihat.
Apakah lembar beta mengandung prolin?
Prolin tidak disukai dalam struktur lembar beta karena tidak dapat menyelesaikan jaringan ikatan-H. Ketika prolin benar-benar terjadi dalam lembaran, mungkin dalam tonjolan atau tepi lembaran di mana kekurangan donor ikatan hidrogen amino tidak kritis.
Apa yang mengandung heliks alfa?
Alpha helix (α-helix) adalah motif umum dalam struktur sekunder protein dan merupakan konformasi heliks tangan kanan di mana setiap tulang punggung gugus N−H hidrogen berikatan dengan tulang punggung C=O. kelompok asam amino yang terletak empat residu sebelumnya di sepanjang urutan protein.
