Sebaliknya, sebagian besar ligase DNA eukariotik, bersama dengan enzim archaeal dan bakteriofag, termasuk dalam subfamili kedua; enzim ini memanfaatkan ATP sebagai kofaktor.
Apakah ligase membutuhkan ATP?
Dua ligase DNA biasanya digunakan. … T4 ligase membutuhkan ATP sedangkan E. coli ligase membutuhkan NAD+ (Nicotinamide adenine dinucleotide adalah koenzim yang terdiri dari 2 nt yang bergabung melalui gugus fosfatnya). Keduanya mengkatalisis penggabungan gugus 5′-fosfat dan 3′-OH untuk membentuk ikatan fosfodiester.
Mengapa ligase membutuhkan ATP?
Dua langkah reaksi ligasi DNA
Reaksi ligasi DNA itu sendiri memiliki dua langkah dasar. Pertama ujung DNA harus bertabrakan secara kebetulan dan tetap bersama cukup lama agar ligase bergabung dengan mereka. … Agar enzim dapat melakukan reaksi lebih lanjut, AMP di sisi aktif enzim harus diisi ulang oleh ATP.
Apa fungsi ligase?
DNA ligase memainkan peran penting dalam mempertahankan integritas genom dengan menggabungkan pemutusan pada tulang punggung fosfodiester DNA yang terjadi selama replikasi dan rekombinasi, dan sebagai konsekuensi dari kerusakan DNA dan memperbaiki. Tiga gen manusia, LIG1, LIG3 dan LIG4 mengkode ligase DNA yang bergantung pada ATP.
Apa ligase itu bekerja secara aktif atau pasif?
DNA ligase aktif selama proses replikasi, perbaikan dan rekombinasi DNA. Ini diterapkan secara luas dalam perbaikan untai tunggalpemecahan DNA dupleks organisme hidup menggunakan untai komplementer dari heliks ganda sebagai cetakan, sementara beberapa bentuk mungkin secara khusus memperbaiki kerusakan untai ganda.
