Dengan penangkapan konformasi kromosom?

Dengan penangkapan konformasi kromosom?
Dengan penangkapan konformasi kromosom?
Anonim

Penangkapan konformasi kromosom (3C) metode berbasis mengungkapkan organisasi kromosom di dalam nukleus dengan menentukan kedekatan fisik pasangan titik di sepanjang kromatin. Mereka mempertahankan interaksi kromatin dengan menghubungkan silang diikuti dengan fragmentasi, ligasi dan pengurutan daerah yang berinteraksi.

Bagaimana cara kerja penangkapan konformasi kromosom?

Konformasi kromosom menangkap-on-chip (4C) menangkap interaksi antara satu lokus dan semua lokus genom lainnya. Ini melibatkan langkah ligasi kedua, untuk membuat fragmen DNA yang disirkulasikan sendiri, yang digunakan untuk melakukan PCR terbalik. … Pada satu microarray, sekitar satu juta interaksi dapat dianalisis.

Apa yang dimaksud dengan penangkapan konformasi kromatin?

Chromatin Conformation Capture (3C) adalah teknik penting yang digunakan untuk mempelajari struktur kromatin, serta dasar untuk beberapa teknik turunan lainnya. … Protokol ini melibatkan ikatan silang formaldehida sel diikuti dengan isolasi kromatin dan pencernaan dengan enzim restriksi.

Bagaimana cara kerja pengurutan Hi-C?

Pendekatan Hi-C memperluas 3C-Seq untuk memetakan seluruh genom kontak kromatin, dan itu juga telah diterapkan untuk mempelajari interaksi kromatin in situ. Dalam metode ini, kompleks DNA-protein dihubungkan silang dengan formaldehida. Sampel dipecah, dan DNA diekstraksi, diikat, dan dicerna dengan enzim restriksi.

Apa itu teknik Hi-C?

Teknik Hi-C klasik melibatkan pencernaan restriksi genom ikatan silang formaldehida dengan urutan enzim restriksi spesifik, diikuti dengan pengisian dan perbaikan ujung yang dicerna dengan penggabungan nukleotida terkait biotin. Ujung yang diperbaiki kemudian diikat kembali.

Direkomendasikan: